新三板公司中有部分公司，身处新兴行业(比如互联网+)，具备高成长性，这恐怕是新三板里最的部分。以互联网企业为例，大多数互联网公司，可能在发展早期并没有盈利，但也不妨碍它们市值的高速成长(比如用户数等指标的增长)，这类公司的投资价值显而易见。在新三板的大池子里，可能有各种各样有潜力的公司等待挖掘，这点让很多机构投资者备感兴奋。
前海开源基金子公司联席总经理付柏瑞比喻称：“传统行业的池子已越来越少，而新三板的池子正在疯狂往里倒水。我们自然也要进去，因为赚钱相对容易。”
付柏瑞认为，新三板的机会在于三个存量，即市值存量、经济存量和投资者存量，这三个存量都需要转型。存量就是水，而转型就是一个池子注向另一个池子的过程。当然创业板也代表了一些新兴行业，但新三板代表了更新兴的行业以及更先导性的公司。
据不完全统计，截至去年底，新三板挂牌公司的整体分布呈现两大特点：一是中小微企业占比高；二是科技含量高，高新技术企业占比超过75%。挂牌公司主要是创新性、创业型、成长型的中小微企业。新三板剔除金融业后的净利润增速为18.86%，高于中小板的6.38%以及创业板的15.17%。
短期来看，新三板的收益可能还主要来自流动性改善和制度性溢价，但这些都不是本题，核心恐怕仍是企业的盈利能力和成长性。不同投资标的估值，以及可能带来的收益差距甚远，因而选择个股的能力也就成为投资收益高低的决定性因素。
当然，从去年底开始已经是新三板投资的较好时机，主要归功于流动性的迅速改善。随着交易方式的多样化，包括已经推出的做市商制度和即将推出的新三板分层和竞价交易制度，未来投资新三板的退出方式也更加丰富了，主要包括交易退出(协议转让、做市交易、竞价交易)、转板退出、并购退出。近期悄然盛行的上市公司并购新三板企业，就让PE 和VC 等机构投资者看到了快速退出的通道。入场资金对退出方式形成了充分的心理预期。
尽管资金涌入，但新三板的整体估值从绝对水平看仍较低。银河证券基金研究中心总经理胡立峰表示，新三板大发展，第一步是挂牌数量居各板块第一，预计今年底5000 家，明年底10000 家，后年增加到15000 家；第二步，挂牌股本逐步增加；第三步，总市值逐步增长，新三板目前平均股价为7.68 元，为各板最低，远远低于创业板的26.56 元，甚至低于上海主板的9.32 元。总体看，市场仍有上升空间。
选股标准
那么对涉足新三板的机构投资者来说，选股的标准是什么？
付柏瑞称：“我不怕买贵，就怕买错。”相比较于市盈率这类估值而言，选公司是重中之重。
“我觉得一个公司比如贵10%买和贵20%买，在新三板根本不是问题，因为它的成长性非常好，它的估值也非常低，关键是我会不会买错。贵和便宜目前并不是新三板市场上选股的主要原因，重点是这个公司的未来是否前途，这是我首先要判断的。”
付柏瑞表示，在其投资标的中，首先选的是行业。“我现在有一个想法，我希望我的投资组合中有些公司是A 股市场没有的。如果A 股市场有，就算市盈率70 倍或80 倍估值也能比较。我认为最好只有在纳斯达克能找到同样盈利模式的公司。可能在纳斯达克市场上它是200 倍估值或者没有估值，比如说亏损的互联网公司。所以投资标的的选择就是要独特行业前景大，但是处于导入期，公司还非常小。”
“另一个，我会判断有哪些公司在未来三五年会成为新三板市场的蓝筹。也就是说未来任何一个投资者，当它对新三板这些公司做出研究以后，它有80%以上的概率都会投我这个组合里的公司，这些公司的估值我认为在未来两三年以后会明显高于其他新三板公司的估值。”
财通基金研究部副总监向禹辰则表示，新三板应重点关注两类公司。第一类是代表中国经济发展方向的创新型公司，“通常最好的创新类公司要么在A 股上市，要么到海外上市，在新三板里没有任何瑕疵的公司是没有的。但有的公司我仔细分析它为什么在新三板上市，它的特点是它的行业非常新，因为只有在新行业里面，大家都看不懂，所以它没有去纳斯达克或者在主板上市，只有这种可能性”。
“所以这是我找这类公司的标准，就是找行业里面的龙头公司，它是最有可能到最后成长起来的公司。”向禹辰表示。
第二类公司是看公司的掌舵人，是否具有优秀的企业家，也就是选人。向禹辰说：“有些企业1999 年成立，你会发现企业底子好，技术好，是一个金矿，大家没有发现。很多这类企业的老板，文化水平非常高，他有时候不以股东目的最大化去经营企业。我举一个例子，一位老板要求他的客户至少达到他心目中最低标准之上的水平，所以他的客户是依云，农夫山泉给他订单他也不做，你给多少钱我也不做。我很尊重这类人，随着公司在新三板挂牌，他很多观念也在转变，因为这个企业的底蕴很好，所以有望升级。”
风险在何处
不过在新三板爆红之后，其背后暗藏的风险却被淡忘了。首先是其拾级而上的估值水平。尽管平均估值较低，但热门股的估值显然并不低，有些甚至很高。随着公募基金、私募基金以及个人陆续进入这个市场，做市商越来越多，热门公司股价扶摇直上。按照向禹辰的话来说，“和企业今天谈好4.8 元，明天就变成4.9 元了”。
“新三板很热闹，但乐观一点最多只有10%的企业在未来会比较有交易量。其余的会和H 股一样，变成仙股。”向禹辰表示。
某业内人士则认为，从目前新三板产品的热卖来看，预计会有更多资金进入新三板市场。但显而易见新三板的市场容量相对较小，这可能导致整个市场估值水平的快速上涨，相应的收益率空间也在减小，投资者需择时而入。
另一个风险是流动性。尽管有做市商制度，新三板市场的流动性仍非常低。一般单个公司的投资期限较长，而投资于新三板的基金产品锁定期也比较长。目前，大多数产品的期限都在3 年左右。从产品设计上看，现有的新三板产品，一般以3 年期或3+1 年期居多，且基本全部封闭，有的产品投资者可中途赎回，但需支付赎回费。这也意味着投资者自身需要承担一定的流动性风险。而机构在投资新三板公司时，单个项目的退出也可能在一年左右。所以，个人投资新三板产品所面临的流动性风险是双重的。
另外，目前不少热门公司的估值已经一步到位，甚至接近创业板，市场未来预期便是“转板”。但转板的游戏规则目前还没有明确，也是另一大隐含的政策风险。
估值、流动性，加上透明度较低，公司成长可能达不到预期，退出存在意外，这些都是投资新三板的风险点所在。不过总体看来，目前仍是潜在收益大于风险，早进入的投资者更有优势。